ラクーンシティの研究所から漏れだした改造ウイルスが凶暴なゾンビを大量発生させ、人類に永遠の恐怖を刻み込んだバイオハザード(生物災害)。だがその同じ時、別の場所でもうひとつのバイオハザードが起きていた。
しかし、『秘密研究都市バイオシティ』で発生したその事故(?)は軍の手で秘密裏に処理され闇から闇に葬り去られた・・・
そしてそれから９年・・・
いまやゴーストタウンと化し永久封印されたはずの廃墟で謎の人物たちが蠢きはじめた・・・
生物部隊・・・ゾンビバスター・・・女戦士・・・そして謎の美少女・・・かれらの目的はいったい何か? 今驚くべき真実が明かされる・・・!
(注意…ストーリーは若干変わる可能性があります)